与传统的探头超声波破碎仪，探头与样品直接接触，一次只能处理一个样品，实验周期长；对于多个样品，需要重复使用同一探头，容易造成样品交叉污染。由于每次探头插入样品的深度不用，每次超声的能量分布也不尽相同，影响实验结果的重复性和准确性。此外，由于不能采用封闭系统，在超声过程中产生的气雾或者泡沫会扩散到环境中，造成潜在的生物危险。

　　非接触式超声碎破仪对于水的要求，首先要洁净，简单说就是没有杂质，这个时候很多同学就会想到直接用超纯水，够干净。可惜干净过头了，超纯水是去离子水，水中本该有的各种元素离子都被除去了，前面所提到的微观爆炸力也就大打折扣了，所以一定要用洁净的非去离子水。机器水槽里的水和样品管里面的水都要遵循这一原则。

　　非接触式超声碎破仪采用在水槽底部安装超声波发生装置的设计，传统的探头超声波破碎仪，超声波引起的微流动现象只能在靠近探头的区域出现，超声破碎仪在实验过程中，样品分别置于独立的全密封离心管中，样本之间不存在任何交叉污染，避免了气雾的传播，增强了实验的生物安全性。